Skip to main content
Ctrl+K
Logo image
0.15.1

Site Navigation

  • Getting Started
  • Example Gallery
  • User Guide
  • API Reference
  • Community
  • Contributing
  • About

Site Navigation

  • Getting Started
  • Example Gallery
  • User Guide
  • API Reference
  • Community
  • Contributing
  • About

Section Navigation

  • Plots
    • arviz.plot_autocorr
    • arviz.plot_bf
    • arviz.plot_bpv
    • arviz.plot_compare
    • arviz.plot_density
    • arviz.plot_dist
    • arviz.plot_dist_comparison
    • arviz.plot_dot
    • arviz.plot_ecdf
    • arviz.plot_elpd
    • arviz.plot_energy
    • arviz.plot_ess
    • arviz.plot_forest
    • arviz.plot_hdi
    • arviz.plot_kde
    • arviz.plot_khat
    • arviz.plot_loo_pit
    • arviz.plot_lm
    • arviz.plot_mcse
    • arviz.plot_pair
    • arviz.plot_parallel
    • arviz.plot_posterior
    • arviz.plot_ppc
    • arviz.plot_rank
    • arviz.plot_separation
    • arviz.plot_trace
    • arviz.plot_ts
    • arviz.plot_violin
  • Stats
    • arviz.apply_test_function
    • arviz.compare
    • arviz.hdi
    • arviz.kde
    • arviz.loo
    • arviz.loo_pit
    • arviz.psislw
    • arviz.r2_score
    • arviz.summary
    • arviz.waic
  • Diagnostics
    • arviz.bfmi
    • arviz.ess
    • arviz.rhat
    • arviz.mcse
  • Stats utils
    • arviz.autocov
    • arviz.autocorr
    • arviz.make_ufunc
    • arviz.wrap_xarray_ufunc
  • Data
    • arviz.from_beanmachine
    • arviz.from_cmdstan
    • arviz.from_cmdstanpy
    • arviz.from_emcee
    • arviz.from_numpyro
    • arviz.from_pyjags
    • arviz.from_pyro
    • arviz.from_pystan
    • arviz.convert_to_inference_data
    • arviz.convert_to_dataset
    • arviz.dict_to_dataset
    • arviz.from_dict
    • arviz.from_json
    • arviz.from_netcdf
    • arviz.to_netcdf
    • arviz.concat
    • arviz.extract
    • arviz.list_datasets
    • arviz.load_arviz_data
  • InferenceData
    • arviz.InferenceData
      • arviz.InferenceData.__init__
      • arviz.InferenceData.add_groups
      • arviz.InferenceData.assign
      • arviz.InferenceData.assign_coords
      • arviz.InferenceData.chunk
      • arviz.InferenceData.compute
      • arviz.InferenceData.copy
      • arviz.InferenceData.cumsum
      • arviz.InferenceData.extend
      • arviz.InferenceData.from_netcdf
      • arviz.InferenceData.from_zarr
      • arviz.InferenceData.get
      • arviz.InferenceData.get_index
      • arviz.InferenceData.groups
      • arviz.InferenceData.isel
      • arviz.InferenceData.items
      • arviz.InferenceData.keys
      • arviz.InferenceData.load
      • arviz.InferenceData.map
      • arviz.InferenceData.max
      • arviz.InferenceData.mean
      • arviz.InferenceData.median
      • arviz.InferenceData.min
      • arviz.InferenceData.persist
      • arviz.InferenceData.quantile
      • arviz.InferenceData.rename
      • arviz.InferenceData.rename_dims
      • arviz.InferenceData.rename_vars
      • arviz.InferenceData.reset_coords
      • arviz.InferenceData.reset_index
      • arviz.InferenceData.sel
      • arviz.InferenceData.set_coords
      • arviz.InferenceData.set_index
      • arviz.InferenceData.sortby
      • arviz.InferenceData.stack
      • arviz.InferenceData.sum
      • arviz.InferenceData.to_dataframe
      • arviz.InferenceData.to_dict
      • arviz.InferenceData.to_json
      • arviz.InferenceData.to_netcdf
      • arviz.InferenceData.to_zarr
      • arviz.InferenceData.unify_chunks
      • arviz.InferenceData.unstack
      • arviz.InferenceData.values
    • arviz.InferenceData.get_index
    • arviz.InferenceData.to_dataframe
    • arviz.InferenceData.to_json
    • arviz.InferenceData.from_netcdf
    • arviz.InferenceData.to_netcdf
    • arviz.InferenceData.from_zarr
    • arviz.InferenceData.to_zarr
    • arviz.InferenceData.chunk
    • arviz.InferenceData.compute
    • arviz.InferenceData.load
    • arviz.InferenceData.persist
    • arviz.InferenceData.unify_chunks
    • arviz.InferenceData.groups
    • arviz.InferenceData.items
    • arviz.InferenceData.values
    • arviz.InferenceData.add_groups
    • arviz.InferenceData.extend
    • arviz.InferenceData.assign
    • arviz.InferenceData.assign_coords
    • arviz.InferenceData.rename
    • arviz.InferenceData.rename_dims
    • arviz.InferenceData.set_coords
    • arviz.InferenceData.set_index
    • arviz.InferenceData.isel
    • arviz.InferenceData.sel
    • arviz.InferenceData.reset_index
    • arviz.InferenceData.map
    • arviz.InferenceData.cumsum
    • arviz.InferenceData.max
    • arviz.InferenceData.mean
    • arviz.InferenceData.median
    • arviz.InferenceData.min
    • arviz.InferenceData.quantile
    • arviz.InferenceData.sum
    • arviz.InferenceData.stack
    • arviz.InferenceData.unstack
  • Plot utils
    • arviz.labels.BaseLabeller
      • arviz.labels.BaseLabeller.__init__
      • arviz.labels.BaseLabeller.dim_coord_to_str
      • arviz.labels.BaseLabeller.make_label_flat
      • arviz.labels.BaseLabeller.make_label_vert
      • arviz.labels.BaseLabeller.make_model_label
      • arviz.labels.BaseLabeller.make_pp_label
      • arviz.labels.BaseLabeller.model_name_to_str
      • arviz.labels.BaseLabeller.sel_to_str
      • arviz.labels.BaseLabeller.var_name_to_str
      • arviz.labels.BaseLabeller.var_pp_to_str
    • arviz.labels.DimCoordLabeller
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.__init__
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.dim_coord_to_str
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.make_label_flat
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.make_label_vert
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.make_model_label
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.make_pp_label
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.model_name_to_str
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.sel_to_str
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.var_name_to_str
      • arviz.labels.DimCoordLabeller.var_pp_to_str
    • arviz.labels.IdxLabeller
      • arviz.labels.IdxLabeller.__init__
      • arviz.labels.IdxLabeller.dim_coord_to_str
      • arviz.labels.IdxLabeller.make_label_flat
      • arviz.labels.IdxLabeller.make_label_vert
      • arviz.labels.IdxLabeller.make_model_label
      • arviz.labels.IdxLabeller.make_pp_label
      • arviz.labels.IdxLabeller.model_name_to_str
      • arviz.labels.IdxLabeller.sel_to_str
      • arviz.labels.IdxLabeller.var_name_to_str
      • arviz.labels.IdxLabeller.var_pp_to_str
    • arviz.labels.DimIdxLabeller
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.__init__
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.dim_coord_to_str
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.make_label_flat
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.make_label_vert
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.make_model_label
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.make_pp_label
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.model_name_to_str
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.sel_to_str
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.var_name_to_str
      • arviz.labels.DimIdxLabeller.var_pp_to_str
    • arviz.labels.MapLabeller
      • arviz.labels.MapLabeller.__init__
      • arviz.labels.MapLabeller.dim_coord_to_str
      • arviz.labels.MapLabeller.make_label_flat
      • arviz.labels.MapLabeller.make_label_vert
      • arviz.labels.MapLabeller.make_model_label
      • arviz.labels.MapLabeller.make_pp_label
      • arviz.labels.MapLabeller.model_name_to_str
      • arviz.labels.MapLabeller.sel_to_str
      • arviz.labels.MapLabeller.var_name_to_str
      • arviz.labels.MapLabeller.var_pp_to_str
    • arviz.labels.NoModelLabeller
      • arviz.labels.NoModelLabeller.__init__
      • arviz.labels.NoModelLabeller.dim_coord_to_str
      • arviz.labels.NoModelLabeller.make_label_flat
      • arviz.labels.NoModelLabeller.make_label_vert
      • arviz.labels.NoModelLabeller.make_model_label
      • arviz.labels.NoModelLabeller.make_pp_label
      • arviz.labels.NoModelLabeller.model_name_to_str
      • arviz.labels.NoModelLabeller.sel_to_str
      • arviz.labels.NoModelLabeller.var_name_to_str
      • arviz.labels.NoModelLabeller.var_pp_to_str
    • arviz.labels.NoVarLabeller
      • arviz.labels.NoVarLabeller.__init__
      • arviz.labels.NoVarLabeller.dim_coord_to_str
      • arviz.labels.NoVarLabeller.make_label_flat
      • arviz.labels.NoVarLabeller.make_label_vert
      • arviz.labels.NoVarLabeller.make_model_label
      • arviz.labels.NoVarLabeller.make_pp_label
      • arviz.labels.NoVarLabeller.model_name_to_str
      • arviz.labels.NoVarLabeller.sel_to_str
      • arviz.labels.NoVarLabeller.var_name_to_str
      • arviz.labels.NoVarLabeller.var_pp_to_str
    • arviz.labels.mix_labellers
    • arviz.sel_utils.xarray_sel_iter
    • arviz.sel_utils.xarray_var_iter
    • arviz.sel_utils.xarray_to_ndarray
  • Utils
    • arviz.Numba
    • arviz.Dask
    • arviz.ColumnDataSource
    • arviz.create_layout
    • arviz.output_notebook
    • arviz.output_file
    • arviz.show_layout
    • arviz.to_cds
    • arviz.interactive_backend
  • rcParams
    • arviz.rc_context
  • Wrappers
    • arviz.SamplingWrapper
      • arviz.SamplingWrapper.__init__
      • arviz.SamplingWrapper.check_implemented_methods
      • arviz.SamplingWrapper.get_inference_data
      • arviz.SamplingWrapper.log_likelihood__i
      • arviz.SamplingWrapper.sample
      • arviz.SamplingWrapper.sel_observations
    • arviz.CmdStanPySamplingWrapper
      • arviz.CmdStanPySamplingWrapper.__init__
      • arviz.CmdStanPySamplingWrapper.check_implemented_methods
      • arviz.CmdStanPySamplingWrapper.get_inference_data
      • arviz.CmdStanPySamplingWrapper.log_likelihood__i
      • arviz.CmdStanPySamplingWrapper.sample
      • arviz.CmdStanPySamplingWrapper.sel_observations
    • arviz.PyMCSamplingWrapper
      • arviz.PyMCSamplingWrapper.__init__
      • arviz.PyMCSamplingWrapper.check_implemented_methods
      • arviz.PyMCSamplingWrapper.get_inference_data
      • arviz.PyMCSamplingWrapper.log_likelihood__i
      • arviz.PyMCSamplingWrapper.sample
      • arviz.PyMCSamplingWrapper.sel_observations
    • arviz.PyStanSamplingWrapper
      • arviz.PyStanSamplingWrapper.__init__
      • arviz.PyStanSamplingWrapper.check_implemented_methods
      • arviz.PyStanSamplingWrapper.get_inference_data
      • arviz.PyStanSamplingWrapper.log_likelihood__i
      • arviz.PyStanSamplingWrapper.sample
      • arviz.PyStanSamplingWrapper.sel_observations
    • arviz.PyStan2SamplingWrapper
      • arviz.PyStan2SamplingWrapper.__init__
      • arviz.PyStan2SamplingWrapper.check_implemented_methods
      • arviz.PyStan2SamplingWrapper.get_inference_data
      • arviz.PyStan2SamplingWrapper.log_likelihood__i
      • arviz.PyStan2SamplingWrapper.sample
      • arviz.PyStan2SamplingWrapper.sel_observations
  • Stats (requiring refitting)
    • arviz.reloo
  • API Reference
  • Wrappers

Wrappers#

Experimental feature

SamplingWrapper(model[, idata_orig, ...])

Class wrapping sampling routines for its usage via ArviZ.

CmdStanPySamplingWrapper(data_file, **kwargs)

CmdStanPy sampling wrapper base class.

PyMCSamplingWrapper(model[, idata_orig, ...])

PyMC (4.0+) sampling wrapper base class.

PyStanSamplingWrapper(model[, idata_orig, ...])

PyStan (3.0+) sampling wrapper base class.

PyStan2SamplingWrapper(model[, idata_orig, ...])

PyStan (2.x) sampling wrapper base class.

previous

arviz.rc_context

next

arviz.SamplingWrapper

Edit on GitHub
Show Source
Support ArviZ

© Copyright 2018, ArviZ devs.

Created using Sphinx 5.3.0.

Built with the PyData Sphinx Theme 0.13.1.